Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp30Q3UN04 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms