Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms