Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cog7Q3UM29 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms