Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms