Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zyg11bQ3UFS0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms