Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21748Q3UE70 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms