Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip13Q3UA06 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip13Q3UA06 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms