Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U595 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U595 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q3U595 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q3U595 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3U595 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms