Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorlQ3U285 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorlQ3U285 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LcorlQ3U285 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LcorlQ3U285 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms