Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U1D9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U1D9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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