Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tatdn3Q3U1C6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms