Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Srsf6Q3TWW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srsf6Q3TWW8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms