Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Shcbp1lQ3TTP0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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