Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q3TTJ4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3TTJ4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms