Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TQQ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TQQ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms