Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdnep1Q3TP92 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdnep1Q3TP92 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms