Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp4cQ3TKR3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp4cQ3TKR3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms