Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gbp8Q2V6D6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbp8Q2V6D6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms