Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne9Q1RLL3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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