Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Rpusd2Q149F1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms