Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col19a1Q0VF58 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms