Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms