Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal1Q0VBP7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms