Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms