Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms