Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms