Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc4Q08624 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc4Q08624 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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