Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnma1Q08460 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms