Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cnn1Q08091 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cnn1Q08091 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cnn1Q08091 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cnn1Q08091 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cnn1Q08091 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cnn1Q08091 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cnn1Q08091 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cnn1Q08091 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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