Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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MestQ07646 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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MestQ07646 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MestQ07646 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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MestQ07646 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MestQ07646 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MestQ07646 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MestQ07646 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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