Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a2Q07643 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms