Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col17a1Q07563 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col17a1Q07563 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col17a1Q07563 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col17a1Q07563 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col17a1Q07563 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col17a1Q07563 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms