Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn3Q07409 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms