Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms