Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms