Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sh3bp2Q06649 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sh3bp2Q06649 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sh3bp2Q06649 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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