Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dcst1Q059Y8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms