Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top1Q04750 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms