Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms