Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnd1Q03719 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnd1Q03719 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms