Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms