Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Crisp3Q03402 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Crisp3Q03402 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms