Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfiaQ02780 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms