Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms