Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms