Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms