Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme2Q01768 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nme2Q01768 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms