Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mc1rQ01727 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms