Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms