Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb2Q00977 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms